Ein negatives Ergebnis schließt eine Amöbiasis nicht aus, da der Erreger intermittierend im Stuhl ausgeschieden wird.
Der Test kann nicht zwischen Entamoeba histolytica (pathogen) und Entamoeba dispar (apathogen) unterscheiden.
Bei Verdacht auf eine extraintestinale Amöbiasis wird der Nachweis spezifischer Antikörper gegen Entamoeba histolytica im Serum empfohlen.